PC-BSD 8.2 i386 にソフトウェア管理で入れた NetBeans 6.9.1 を起動してみたら日本語が全部四角（豆腐）に！
でも、次のようにやってみたら、日本語が表示できました。
> su - # cd /Programs/NetBeans/jdk1.6.0/jre/lib/fonts # mkdir fallback # cd fallback/ # ln -s /usr/local/share/font-vlgothic/VL-Gothic-Regular.ttf # ln -s /usr/local/share/font-vlgothic/VL-PGothic-Regular.ttf
上は、Mandriva Linux上のOpenJDKのGUIフォントが豆腐になる件とその対処を参考にしました。
事前に OpenJDK をインストールしてたので、その設定が問題なのかと思ってやってみても状況は変わりませんでした。
ですが、 NetBeans のインストールディレクトリ内の JDK の JRE の設定を変えた所、日本語が表示されました。
NetBeans のパッケージにも JRE を含む JDK が入っていて、 NetBeans の起動には、そちらの方が使われるようですね。